In Anerkennung hervorragender wissenschaftlicher Leistungen oder anderer besonderer Verdienste kann die Friedrich-Schiller-Universität Jena durch ihre Fakultäten den Doktor ehrenhalber als seltene Auszeichnung verleihen.
Seit 1990 ist die Ehrendoktorwürde an folgende Persönlichkeiten verliehen worden:
Theologische Fakultät
- Rt Rev Nicholas M. Baines
Bischof von Leeds - The Very Rev. Prof. em. Dr. Henry Chadwick DD. KBE. FBA
em. Regius Professor of Divinity der Universitäten Oxford und Cambridge (England) - Prof. Dr. Dr. h. c. Pumla Gobodo-Madikizela
südafrikanische Psychologin und Versöhnungsforscherin - Prof. Dr. theol. Otto Kaiser
em. Professor für Altes Testament der Philipps-Universität Marburg - Prof. Dr. Bruce L. McCormack
amerik. Barth-Experte - Prof. Dr. John Wiliam Rogerson
emeritierter Theologie Professor Uni Sheffield - Prof. Dr. Dr. h. c. Otto Hermann Pesch (†)
em. Theologie Professor Uni Hamburg - Prof. em. Dr. theol. Dr. h.c. Dr. h.c. Jacques Waardenburg (†)
niederländischer Theologe, Religions- und Islamwissenschaftler - Prof. Dr. Dr. h. c. Hans Weder
em. Theologie Uni Zürich - Prof. Dr. Euler Renato Westphal
brasilianische Theologe
Rechtswissenschaftliche Fakultät
- Hans-Joachim Bauer
ehem. Präsident des Oberlandesgerichts Jena - Prof. Dr. Stanisław Biernat
ordentlicher Professor an der Fakultät für Recht und Verwaltung der Jagiellonen-Universität Krakau und Vizepräsident des polnischen Verfassungsgerichtshofes - Dr. jur. Walter David (†)
ehem. Chefjustitiar der Zeiss-Stiftung Oberkochen - Prof. Dr. Dres. h. c. Wolfgang Huber
Alt-Bischof der Evangelischen Kirche Berlin-Brandenburg-schlesische Oberlausitz, ehemaliger Ratsvorsitzender der Evangelischen Kirche in Deutschland (EKD) - Dr. iur. Hans-Joachim Jentsch (†)
ehem. Richter am Bundesverfassungsgericht - Stefan Kaufmann
Präsident des Thüringer Oberlandesgerichts - Dr. Klaus Kübel (†)
Kanzler der Universität Jena 1990-2007 - Prof. Dr. Chien-Liang Lee
Institutum Iurisprudentiae Academia Sinica - Prof. Dr. Dres. h.c. Marcus Lutter
em. Professor und Direktor des Instituts für Handels- und Wirtschaftsrecht, Universität Bonn - Günter Schaub (†)
Vorsitzender Richter am Bundesarbeitsgericht i.R. - Elmar Joseph Schuler
Präsident des Thüringer Finanzgerichts - Prof. Dr. Dieter Schwab
Rechtshistoriker, Familienrechtsexperte - Prof. Dr. iur. Tore Sigeman
em. Professor für Bürgerliches Recht und Arbeitsrecht an den Universitäten Stockholm und Uppsala
Wirtschaftswissenschaftliche Fakultät
- Peter Draper
südafrikanischer Wirtschaftswissenschaftler - Professor Steven Klepper (PhD)
Professor of Economics and Social Science der Carnegie Mellon University in Pittsburgh - Jürgen Radomski
ehem. Siemens Personalvorstand - Wolfgang Spindler
Vizepräsident des Bundesfinanzhofes
Philosophische Fakultät
- Prof. Dr. sc. phil. Manfred Bierwisch
em. Professor für Linguistik an der Humboldt-Universität zu Berlin, Vizepräsident der Berlin-Brandenburgischen Akademie der Wissenschaften - Prof. Dr. Włodzimierz Borodziej (†)
polnischer Historiker und ehemaliger Co-Direktor des "Imre Kertész Kollegs Jena" - Prof. Dr. Wolfgang Deurer (†)
freier Architekt und Kirchenbaumeister der Stadtkirche St. Michael in Jena - Prof. Dr. Dr. h.c. Gonthier-Louis Fink
franz. Germanist - Dr. theol. h.c. Joachim Gauck
ehem. Beauftragter der Bundesregierung für die Unterlagen der Staatssicherheit - Prof. Dr. Dr. h. c. mult. Dieter Henrich (†)
Experte für die Philosophiegeschichte des 18. bis 20. Jahrhunderts - Wulf Kirsten (†)
deutscher Lyriker, Prosaist und Herausgeber - Imi Knoebel
deutscher Künstler - Prof. Dr. phil. Odo Marquard (†)
em. Professor für Philosophie der Justus-Liebig-Universität Gießen - Dr. h.c. Herta Müller
Schriftstellerin und Literatur-Nobelpreisträgerin - Dr. h.c. Dr. h.c. Frank Stella (†), New York City
Freier Künstler - Dr. Volker Ullrich
ZEIT-Redakteur und Historiker
Fakultät für Sozial- und Verhaltenswissenschaften
- Prof. Dr. Niels Birbaumer
Psychologe und Neurobiologe - Dr. Hildegard Hamm-Brücher (†)
Politikerin - Staatsministerin a. D. (Erziehungswissenschaft) - Roland Jahn
Bundesbeauftragter für die Unterlagen des Staatssicherheitsdienstes der ehemaligen Deutschen Demokratischen Republik (BStU) - Prof. Dr. Karl G. Jöreskog
schwedischer Wissenschaftler - Vater der Strukturgleichungsmodelle - Prof. Dr. Gerd Lüer
em.Professor für Psychologie an der Georg-August-Universität Göttingen - Prof. Dr. K. Warner Schaie, Ph.D.
Evan Pugh Professor of Human Development and Psychology, Pennsylvania State University - Eduard Schewardnadse (†)
ehemaliger Staatspräsident Georgiens - Prof. Dr. Hans-Peter Schwarz (†)
Politikwissenschaftler - Prof. Dr. Erwin K. Scheuch
Soziologe - Prof. Dr. Allen J. Scott
Sozialwissenschaftler
Fakultät für Mathematik und Informatik
- Prof. Dr. phil. nat. Dr. h.c. mult. Gerhard Krüger
Professor für Informatik, Universität Karlsruhe - Prof. Dr. phil. Boris A. Trachtenbrot
Professor für Informatik, School of Mathematical Sciences, Tel Aviv University (Israel) - Prof. Dr. Hartmut Wedekind
Datenbankexperte - Prof. Dr. Henryk Wozniakowski
Professor für Mathematik an der Universität Warschau und der Columbia University New York
Physikalisch-Astronomische Fakultät
- Prof. Dr. Abhay Ashtekar
Relativitätsforscher, Direktor des Institut für Gravitations-Physik und -Geometrie an der Pennsylvania State University - Prof. Dr. Michael Kaschke
Vorstandsvorsitzender der Carl Zeiss AG - Prof. Dr. Herbert Kroemer (†)
Nobelpreisträger für Physik und Professor für Physik an der University of California (Santa Barbara) - Dr. Dieter Kurz
ehem. Vorstandsvorsitzender der Carl Zeiss AG - Dr. Reinhart Neubert
Pionier der Laserforschung - Prof. Dr. phil. Dr. h.c. Fritz Peter Schäfer (†)
ehem. Direktor am Max-Planck-Institut für Biophysikalische Chemie, Göttingen - Dr. phil. nat. Hermann Schwarz (†)
ehem. Geschäftsführer der Firma Rohde & Schwarz, München
Chemisch-Geowissenschaftliche Fakultät
- Prof. Dr. John Bannister Goodenough (†)
Miterfinder der Lithium-Ionen-Batterie und Professor an der University of Texas at Austin - Prof. Gerhard Hard
Geograph, emeritierte Ordinarius für Physische Geographie der Universität Osnabrück - Prof. Dr. Dr. h. c. mult. Alan Roy Katritzky
Direktor des "Center for Heterocyclic Compounds" an der University of Florida (USA) - Prof. Dr. Klaus Keil (†)
amerikan. Mineraloge; Direktor des Hawai Institut of Geophysics and Planetology - Prof. Dr. Dr. h.c. Helmut Werner
Experte für Metallorganik
Biologisch-Pharmazeutische Fakultät
- Prof. Dr. rer. nat. Dr. h.c. mult. Sydney Brenner
Direktor des Molecular Sciences Institute, Berkeley, California (USA) - Doz. Dr. rer. nat. habil. Ilse Jahn (†)
Biologiehistorikerin - Prof. Dr. rer. nat. Dr. h.c. mult. Herbert Oelschläger (†)
Professor für Pharmazeutische Chemie und Direktor des Instituts für Pharmazie der Friedrich-Schiller-Universität Jena - Johanna Schlüter
Geschäftsführerin des Gustav-Fischer Verlages Jena
Medizinische Fakultät
- Prof. Dr. med. dent. Karl Eichner (†)
Professor für Zahnärztliche Prothetik der Freien Universität Berlin - Prof. Dr. Simon Finfer
Professor der Universität Sydney und Nestor für hochrangige klinische Forschung auf dem Gebiet der Intensivmedizin - PD Dr. med. Urs Heim
Privatdozent der Universität Bern und Mitarbeiter der AO-International Davos - Prof. Dr. med. Thomas Kenner
Ordinarius für Physiologie an der Universität Graz - Prof. Dr. med. Dietrich Lehmann
Professor für Klinische Neurophysiologie an der Universität Zürich - Prof. Dr. Dr. h.c. mult. Mahmut Gazi Yasargil
Mikroneurochirurg em. Ordinarius für Neurochirurgie in Zürich
Über alle bisher an der Universität Jena verliehenen Ehrendoktorwürden (bis 2005) informieren folgende Publikationen:
Joachim Bauer, Joachim Hartung, Klaus Dicke (Hg.): Die Ehrendoktoren der Friedrich-Schiller-Universität in den Geisteswissenschaften 1800 bis 2005, Hain Verlag, Weimar und Jena 2007, ISBN 978-3-89807-093-5
Joachim Hartung, Andreas Wipf (Hg.): Die Ehrendoktoren der Friedrich-Schiller-Universität in den Bereichen Naturwissenschaften und Medizin, Hain Verlag, Weimer und Jena 2004, ISBN 3-89807-064-6